1. Web版3D可視化網(wǎng)站:本網(wǎng)站支持斑馬魚、小鼠、猴等多物種多類型數(shù)據(jù)的在線展示,包含神經(jīng)元、腦區(qū)、品系、細(xì)胞構(gòu)筑等數(shù)據(jù)。此外,網(wǎng)站還支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索、數(shù)據(jù)顏色、透明度、可見性等屬性設(shè)置。
2. BrAVe (BrainAltas Viewer)腦圖譜數(shù)據(jù)3D可視化軟件: 本軟件基于開源軟件Paraview,支持腦圖譜數(shù)據(jù)三維交互可視化,目前支持的數(shù)據(jù)類型包括:神經(jīng)元、腦區(qū)、細(xì)胞構(gòu)筑、品系數(shù)據(jù),也支持神經(jīng)元形態(tài)分析、神經(jīng)元-腦區(qū)投射分析和腦區(qū)-腦區(qū)投射分析以及分析結(jié)果可視化。
本軟件需要特別致謝斑馬魚腦圖譜團(tuán)隊(duì)(杜久林研究組和斑馬魚介觀腦圖譜平臺),該團(tuán)隊(duì)組織了本軟件早期版本的開發(fā),并且設(shè)計(jì)了許多有用的功能,功能列表可向斑馬魚腦圖譜團(tuán)隊(duì)或者數(shù)據(jù)與計(jì)算中心查詢。
本軟件當(dāng)前只面向腦智中心的用戶公開,但是如果需要使用本軟件的功能發(fā)布論文或者進(jìn)行相關(guān)技術(shù)匯報、交流,需要聯(lián)系數(shù)據(jù)與計(jì)算中心,并征得相關(guān)人員的同意。
3. 數(shù)據(jù)分析和機(jī)器學(xué)習(xí):海量腦數(shù)據(jù)的處理已成為神經(jīng)科學(xué)研究和實(shí)踐中的常態(tài),這對于揭示隱藏的信息以更好地了解大腦功能和信息處理機(jī)制至關(guān)重要。關(guān)于機(jī)器學(xué)習(xí),我們的目標(biāo)是研究如何有效地將這些機(jī)器學(xué)習(xí)算法應(yīng)用于典型的神經(jīng)問題。
4. 生物信息學(xué)分析:生物信息學(xué)分析涉及到全基因組測序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)、全基因組測序數(shù)據(jù)分析、外顯子組測序?qū)嶒?yàn)設(shè)計(jì)和外顯子組測序數(shù)據(jù)分析等。