????人類大腦含有數(shù)百種不同類型、總數(shù)達(dá)近千億(1011)個(gè)的神經(jīng)元,神經(jīng)信號(hào)經(jīng)由神經(jīng)元間的突觸聯(lián)接(總數(shù)約1014)所形成的神經(jīng)環(huán)路進(jìn)行接受、傳遞和處理。腦功能,諸如感知覺(jué)、學(xué)習(xí)、記憶、情感、意識(shí)等,涉及大腦多個(gè)腦區(qū)、多個(gè)核團(tuán)和多種類型神經(jīng)元群體之間的協(xié)作。因此,在全腦尺度上、在細(xì)胞甚至突觸分辨率水平上解析神經(jīng)聯(lián)接的結(jié)構(gòu)和功能,是揭示腦工作原理的重要途徑。大腦是上億年演化的結(jié)晶,其結(jié)構(gòu)復(fù)雜而有序的精巧組織是動(dòng)物適應(yīng)和改造自然的優(yōu)化產(chǎn)物,蘊(yùn)含著必然的合理性、先進(jìn)性和不可替代性。因此,揭示其組織規(guī)律和功能機(jī)制,不僅是理解大腦奧秘的必由之路,也將為發(fā)展類腦智能算法與系統(tǒng)、突破馮·偌依曼構(gòu)架提供策略和思路。
????當(dāng)前,腦科學(xué)研究處于關(guān)鍵的歷史拐點(diǎn),正從聚焦于研究局部腦區(qū)推進(jìn)到在全腦尺度上探索神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)原理和神經(jīng)信息的處理機(jī)制。在基因 - 信號(hào)通路 - 神經(jīng)元形態(tài)與功能 - 神經(jīng)環(huán)路等多個(gè)層次上,脊椎動(dòng)物大腦的結(jié)構(gòu)與功能具有高度的保守性,因此可以通過(guò)研究結(jié)構(gòu)上簡(jiǎn)單的腦來(lái)剖析人類大腦的基本工作原理。斑馬魚(yú)是目前可以從全腦尺度上解讀腦工作原理的模式脊椎動(dòng)物,其大腦相對(duì)小而簡(jiǎn)單(體積約0.1立方毫米)、且又具有相當(dāng)?shù)膹?fù)雜度(共含約105個(gè)神經(jīng)元和108個(gè)突觸聯(lián)接)。目前已可實(shí)現(xiàn)從宏觀(腦區(qū)分辨率)、介觀(細(xì)胞分辨率)、亦或微觀(突觸分辨率)層面上,在全腦尺度上對(duì)斑馬魚(yú)大腦的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行全面而系統(tǒng)的解析。
????本實(shí)驗(yàn)室運(yùn)用跨學(xué)科交叉研究手段,通過(guò)在全腦尺度上對(duì)斑馬魚(yú)大腦結(jié)構(gòu)和功能的系統(tǒng)性研究,旨在通過(guò)剖析105個(gè)神經(jīng)元如何通過(guò)108個(gè)突觸聯(lián)接來(lái)產(chǎn)生各種腦功能與動(dòng)物行為,尋找普適性的大腦結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)原理和神經(jīng)信息的處理機(jī)制。同時(shí),通過(guò)對(duì)多種研究方法的具體需求,合作研發(fā)一系列多學(xué)科交叉創(chuàng)新技術(shù)(包括基因編輯、生物探針、功能成像、大數(shù)據(jù)處理等)。進(jìn)而,基于斑馬魚(yú)全腦結(jié)構(gòu)和功能的實(shí)驗(yàn)研究成果,實(shí)現(xiàn)脊椎動(dòng)物智慧大腦的全腦計(jì)算模擬,發(fā)展全腦計(jì)算模型、系統(tǒng)與理論。比如,斑馬魚(yú)捕食草履蟲(chóng)的過(guò)程,是一個(gè)充滿智慧的過(guò)程,需要針對(duì)相對(duì)空間位置、場(chǎng)景等的不斷變換,連續(xù)做出合理的抉擇,從而發(fā)起恰當(dāng)?shù)倪\(yùn)動(dòng)。該捕食過(guò)程無(wú)論在智能程度、能耗、系統(tǒng)簡(jiǎn)潔度等方面,都是目前人工智能領(lǐng)域的典范AlphaZero系列無(wú)法企及的。捕食過(guò)程所涉及的神經(jīng)原理,包括神經(jīng)環(huán)路結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)和神經(jīng)信息處理,可應(yīng)用于研發(fā)通用智能系統(tǒng)。因此,本實(shí)驗(yàn)室以斑馬魚(yú)為模型開(kāi)展的神經(jīng)系統(tǒng)研究,是一個(gè)全腦尺度上、多層次、多學(xué)科的系統(tǒng)科學(xué)工程,旨在揭示大腦運(yùn)作的基本原理,并推動(dòng)腦科學(xué)與類腦智能的融合和發(fā)展。即所謂“Small Brain, Big Mind”,小小斑馬魚(yú),可以推動(dòng)腦科學(xué)-智能技術(shù)新興交叉學(xué)科的發(fā)展。
????針對(duì)上述研究目標(biāo),我們建立了既見(jiàn)“森林(全腦)、又見(jiàn)樹(shù)木(神經(jīng)元)甚或樹(shù)葉(突觸)”的研究策略,實(shí)現(xiàn)了對(duì)全腦神經(jīng)元結(jié)構(gòu)形態(tài)和功能活動(dòng)的觀測(cè)與調(diào)控,并同時(shí)記錄動(dòng)物的行為。實(shí)驗(yàn)室以視覺(jué)系統(tǒng)為核心,在感覺(jué)輸入到運(yùn)動(dòng)輸出的各個(gè)階段,研究感覺(jué)信息處理、多感覺(jué)整合、感覺(jué)-運(yùn)動(dòng)轉(zhuǎn)換和相關(guān)行為發(fā)生的神經(jīng)環(huán)路與突觸機(jī)制。其次,由于神經(jīng)調(diào)質(zhì)系統(tǒng)的活動(dòng)與情緒、注意、學(xué)習(xí)與記憶等密切相關(guān),并影響感覺(jué)輸入到運(yùn)動(dòng)發(fā)生過(guò)程中每個(gè)環(huán)節(jié)的神經(jīng)信息的處理。因此,我們還研究不同神經(jīng)調(diào)質(zhì)系統(tǒng)(包括多巴胺能、去甲腎上腺素能、五羥色胺能、乙酰膽堿能等)如何對(duì)感覺(jué)-運(yùn)動(dòng)信息處理產(chǎn)生不同的調(diào)節(jié)作用,并不斷完善我們提出的Bi-Pathway Brain Function Hypothesis,旨在闡明動(dòng)物適應(yīng)性行為發(fā)生的基本理論。進(jìn)而,繪制出斑馬魚(yú)全腦神經(jīng)元活動(dòng)的神經(jīng)聯(lián)接功能圖譜、具有細(xì)胞分辨率的全腦神經(jīng)聯(lián)接結(jié)構(gòu)圖譜和具有突觸分辨率的全腦神經(jīng)聯(lián)接結(jié)構(gòu)圖譜,旨在從全腦尺度上,在細(xì)胞和突觸水平上揭示斑馬魚(yú)大腦結(jié)構(gòu)的設(shè)計(jì)原理(即105個(gè)神經(jīng)元和108個(gè)突觸如何聯(lián)接),并闡明神經(jīng)信號(hào)處理的普適規(guī)律。
????大腦功能正常行使依賴于神經(jīng)活動(dòng)相關(guān)的腦代謝與腦血流之間精細(xì)的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)。神經(jīng)元、膠質(zhì)細(xì)胞和血管組成的神經(jīng)-血管功能單元,其正常發(fā)育和功能是保證大腦正常工作的基礎(chǔ)。目前,大腦血管網(wǎng)絡(luò)以及血腦屏障是如何形成的仍是一個(gè)未解之謎。本實(shí)驗(yàn)室另外一個(gè)交叉研究方向是以斑馬魚(yú)為模型,運(yùn)用分子和基因操作、活體成像、腦血管三維結(jié)構(gòu)定量分析、以及神經(jīng)科學(xué)研究相關(guān)手段等,研究腦血管三維網(wǎng)絡(luò)發(fā)育和血腦屏障形成的宏觀規(guī)律與微觀機(jī)制,闡明腦血管與神經(jīng)系統(tǒng)在發(fā)育和功能上的相互作用,尤其是神經(jīng)活動(dòng)對(duì)腦血管發(fā)育的調(diào)節(jié)。
近年來(lái)的主要研究成果包括:
1. 全腦尺度神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和功能研究
1)發(fā)現(xiàn)突觸傳遞長(zhǎng)時(shí)程增強(qiáng)存在于視網(wǎng)膜中,為視覺(jué)經(jīng)驗(yàn)引起的視網(wǎng)膜神經(jīng)環(huán)路的形成提供了突觸機(jī)制(Neuron 2012a)。該工作被 Faculty of 1000推薦,和成果6合并入選2012年度中國(guó)科學(xué)十大進(jìn)展的30條候選進(jìn)展。
2)發(fā)現(xiàn)視網(wǎng)膜自發(fā)活動(dòng)波起源于雙極細(xì)胞,而非經(jīng)典認(rèn)為的無(wú)長(zhǎng)突細(xì)胞,并闡明了其形成的突觸和分子機(jī)制(Nature Communications 2016)、以及Müller膠質(zhì)細(xì)胞的調(diào)控作用(Cell Reports 2019),為視網(wǎng)膜波起源這個(gè)視覺(jué)領(lǐng)域中長(zhǎng)期懸而未決的問(wèn)題提供了一個(gè)明確的答案。研究生獲中國(guó)生理學(xué)會(huì)張錫鈞基金會(huì)優(yōu)秀論文獎(jiǎng)、賽諾菲優(yōu)秀青年科學(xué)家獎(jiǎng)等。
3)發(fā)現(xiàn)視覺(jué)中樞神經(jīng)元和小膠質(zhì)細(xì)胞間的相互作用,揭示了小膠質(zhì)細(xì)胞對(duì)神經(jīng)活動(dòng)具有穩(wěn)態(tài)調(diào)節(jié)功能(Developmental Cell 2012)。該工作被同期雜志和Faculty of 1000點(diǎn)評(píng),被Neuron期刊在二十五周年回顧中評(píng)為領(lǐng)域近年來(lái)最具有影響力的工作(排第一位),被認(rèn)為是揭開(kāi)小膠質(zhì)細(xì)胞生理功能的奠基性工作,被本領(lǐng)域近幾年幾乎所有的重要綜述引用。研究生獲吳瑞獎(jiǎng)和中科院院長(zhǎng)獎(jiǎng)等。
4)發(fā)現(xiàn)多巴胺能神經(jīng)元和抑制性神經(jīng)元組成的功能元件,控制視覺(jué)-運(yùn)動(dòng)轉(zhuǎn)換和行為選擇,揭示了視覺(jué)適應(yīng)性行為產(chǎn)生的神經(jīng)環(huán)路機(jī)制(Neuron 2016),該工作以亮度論文形式發(fā)表。研究生獲吳瑞獎(jiǎng)、中國(guó)神經(jīng)學(xué)會(huì)張香桐神經(jīng)科學(xué)優(yōu)秀研究生論文獎(jiǎng)等。
5)發(fā)現(xiàn)亮偏好行為的不對(duì)稱性神經(jīng)環(huán)路機(jī)制,揭示了左側(cè)韁核在其中的關(guān)鍵作用(Neuron 2017)。工作以亮點(diǎn)論文的形式發(fā)表,并配以Video Abstract重點(diǎn)推薦。研究生獲吳瑞獎(jiǎng)、中科院院長(zhǎng)獎(jiǎng)、中科院優(yōu)秀博士論文獎(jiǎng)、長(zhǎng)三角神經(jīng)科學(xué)青年科學(xué)家獎(jiǎng)、中國(guó)生理學(xué)會(huì)張錫鈞基金會(huì)優(yōu)秀論文獎(jiǎng)等。
6)闡明視覺(jué)對(duì)聽(tīng)覺(jué)-運(yùn)動(dòng)通路功能和行為的跨模態(tài)調(diào)節(jié)的神經(jīng)機(jī)制,發(fā)現(xiàn)丘腦多巴胺能神經(jīng)元介導(dǎo)視-聽(tīng)整合的新功能(Neuron 2012b)。和成果1合并入選2012年度中國(guó)科學(xué)十大進(jìn)展的30條候選進(jìn)展。研究生獲吳瑞獎(jiǎng)、中科院院長(zhǎng)獎(jiǎng)、上海市研究生優(yōu)秀成果獎(jiǎng)等。
7)揭示了藍(lán)斑神經(jīng)系統(tǒng)在介導(dǎo)全身麻醉中的重要作用(Cell Reports 2018)。
2. 腦血管和血腦屏障發(fā)育及其神經(jīng)調(diào)節(jié)
1)揭示腦血管網(wǎng)絡(luò)的宏觀發(fā)育規(guī)律及其機(jī)制,發(fā)現(xiàn)血流變化驅(qū)動(dòng)血管修剪,簡(jiǎn)化腦血管三維網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),提高腦血流效率(PLoS Biology 2012)。工作被PLoS Biology、Nature和Faculty of 1000點(diǎn)評(píng),被國(guó)際同行認(rèn)為是近年來(lái)腦血管領(lǐng)域的一個(gè)重要突破。研究生獲歐洲斑馬魚(yú)國(guó)際大會(huì)、Kloster Seeon國(guó)際血管發(fā)育大會(huì)優(yōu)秀墻報(bào)一等獎(jiǎng)等。
2)揭示大腦血管網(wǎng)絡(luò)發(fā)育過(guò)程中,腦血管路徑選擇的細(xì)胞和分子機(jī)制。發(fā)現(xiàn)大腦血管內(nèi)皮頂端細(xì)胞分支上機(jī)械敏感通道Piezo1介導(dǎo)的鈣離子活動(dòng)的頻率高低決定了頂端細(xì)胞分支的收縮或伸長(zhǎng)的命運(yùn),從而決定血管生長(zhǎng)的路徑選擇和腦血管三維網(wǎng)絡(luò)的形成模式(Neuron 2020)。該工作被同期雜志亮點(diǎn)點(diǎn)評(píng)。成果入選首屆中國(guó)神經(jīng)科學(xué)學(xué)會(huì)中國(guó)神經(jīng)科學(xué)重大進(jìn)展。研究生獲蔡司斑馬魚(yú)研究?jī)?yōu)秀論文一等獎(jiǎng)等。
3)揭示神經(jīng)系統(tǒng)調(diào)節(jié)腦血管功能完整性的分子機(jī)制,發(fā)現(xiàn)神經(jīng)元分泌的含有miR-132的外泌體被腦血管內(nèi)皮細(xì)胞吸收后,通過(guò)調(diào)節(jié)血腦屏障相關(guān)蛋白的表達(dá),從而動(dòng)態(tài)影響腦血管的功能完整性,揭示了外泌體作為腦血管完整性的神經(jīng)調(diào)節(jié)的一個(gè)新的載體(Cell Research 2017)。該工作被同期雜志亮點(diǎn)點(diǎn)評(píng)。
4)揭示血腦屏障的重要細(xì)胞成員-周細(xì)胞入腦的調(diào)控機(jī)制,發(fā)現(xiàn)血流通過(guò)血管內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)的Piezo通道調(diào)控周細(xì)胞中的Notch信號(hào),從而調(diào)節(jié)入腦后的周細(xì)胞增殖,促進(jìn)血腦屏障的形成(Cell Reports 2024)。
5)揭示TRPC1在血管發(fā)育中的重要作用(Circulation Research 2010),論文被 Faculty of 1000推薦,并被當(dāng)年度Circulation Research推薦為Must Read論文。
3. 創(chuàng)新研究技術(shù)
????為開(kāi)展上述基礎(chǔ)研究,實(shí)驗(yàn)室創(chuàng)建了多項(xiàng)領(lǐng)先的在體研究技術(shù)體系,相關(guān)方法已被國(guó)際同行廣為采用,為相關(guān)領(lǐng)域發(fā)展起到了重要的推動(dòng)作用:
1)全腦神經(jīng)活動(dòng)檢測(cè)和調(diào)控技術(shù):全細(xì)胞電生理記錄(Methods in Molecular Biology 2016),清醒斑馬魚(yú)全腦所有神經(jīng)元(10萬(wàn)個(gè))活動(dòng)檢測(cè)和調(diào)控技術(shù)(Biomedical Optics Express 2018),大數(shù)據(jù)流(~ 500MB/s)實(shí)時(shí)處理系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)全腦光學(xué)接口虛擬現(xiàn)實(shí)和全腦閉環(huán)研究新范式(Nature Neuroscience 2024,專利號(hào)ZL20231 0131178.9);
2)探針研發(fā):神經(jīng)元多巴胺釋放檢測(cè)(Journal Neuroscience 2015),紅外電壓敏感納米探針(JACS 2020,入選中國(guó)稀土2020年度十大科技新聞),紅外鉀離子敏感納米探針(Science Advances 2020),新型遺傳編碼色氨酸探針(Cell Discovery 2023);
3)基因編輯方法:內(nèi)含子靶向的不影響內(nèi)源基因的基因敲入(Cell Research 2015,專利號(hào)201510075155.6),大片段DNA置換(JMCB 2020),雙色標(biāo)記的條件性斑馬魚(yú)基因敲除新方法(Science China Life Science 2020,專利申請(qǐng)?zhí)?019112959299);
4)軟件系統(tǒng):腦血管三維網(wǎng)絡(luò)分析系統(tǒng)(PLoS Biology 2012,軟件號(hào)201210017912.0),斑馬魚(yú)房信息化管理系統(tǒng)(軟件號(hào)2021SR0236837)等。
????本實(shí)驗(yàn)室具有高度的學(xué)科交叉特性,擁有一支多學(xué)科交叉的年輕研究團(tuán)隊(duì);成員特長(zhǎng)交叉互補(bǔ),擅長(zhǎng)的技術(shù)領(lǐng)域覆蓋從遺傳、分子、細(xì)胞、電生理、在體成像、光遺傳學(xué)、行為、電鏡、信息科學(xué)、大數(shù)據(jù)分析、光學(xué)等多個(gè)學(xué)科。同時(shí),與國(guó)內(nèi)外近十家實(shí)驗(yàn)室建立長(zhǎng)期穩(wěn)定的跨學(xué)科合作,合作范圍涵蓋探針、光學(xué)成像方法、納米材料、大數(shù)據(jù)快速采集和處理、連續(xù)電鏡成像和重構(gòu)、神經(jīng)環(huán)路結(jié)構(gòu)與功能網(wǎng)絡(luò)重構(gòu)、全腦結(jié)構(gòu)和功能模擬等領(lǐng)域。畢業(yè)的博士生和出站的博士后近俞百次次獲得多種國(guó)內(nèi)外學(xué)術(shù)獎(jiǎng)勵(lì),包括4人獲吳瑞獎(jiǎng)、3人代表中科院參加國(guó)際研究生論壇、11人獲國(guó)際學(xué)術(shù)會(huì)議或?qū)W習(xí)班資助、15人在國(guó)際會(huì)議上做口頭報(bào)告等;14人已在國(guó)內(nèi)、外科研機(jī)構(gòu)獲得獨(dú)立教職/PI。
????實(shí)驗(yàn)室長(zhǎng)期以來(lái)形成了自由探索、鼓勵(lì)創(chuàng)新的學(xué)術(shù)氛圍;重點(diǎn)攻關(guān)、團(tuán)隊(duì)協(xié)作的科研模式;大膽假設(shè)、小心求證的工作作風(fēng);尊重信任、團(tuán)結(jié)有愛(ài)的工作環(huán)境;因材施教、發(fā)揮個(gè)性的指導(dǎo)風(fēng)格;德才兼?zhèn)洹⒁缘聻橄鹊呐囵B(yǎng)宗旨;挑戰(zhàn)自我、追求卓越的奮斗目標(biāo)。
研究組組長(zhǎng);高級(jí)研究員